Pro pomoc v orientaci výsleků z genomického testování uvádím níže přehled základních výsledků a přístup k nim.


JAK SE K VÝSLEDKŮM DOSTAT

  • Prostřednictvím veřejné databáze CDCB, kterou nalezente zde. Lze vyhledávat jednotlivá zvířata (formát CZE000.........) nebo skupiny zvířat se společným znakem tak, že do pole "Reg Name" vepíšete prefix svých zvířat.
  • Jednotlivé pěkné a přehledné katalogové listy zvířat lze najít také na stránce www.stgen.com (vpravo nahoře do pole "Search" je třeba vepsat číslo zvířete (CZE000.........).
  • Prostřednictvím klientského portálu Genetic Visions, kde naleznete vždy poslední a aktuální výsledky a stav každé jednotlivé "objednávky" rozborů.
    • Zaregistrujete se
    • Oznámíte nám email, se kterým jste se registrovali
    • Vyčkáte spárování Vašeho uživatelského účtu se svými výsledky
    • Prohlížejte výsledky

CHORUSIC SOUND SARA 5

VÝSTUPY CDCB

Nejpřehlednější informace o každém jednotlivém zvířeti získáte právě prostřednictvím veřejné databáze stgen.com.

Záhlaví: Jméno zvířete, číslo, datum narození.

Dále následuje poslední přepočet plemenných hodnot.

V pravém horním kvartálu naleznete také historii přepočtů PH a lze tak pěkně vidět, jak se v čase PH zvířat mění. Obvykle se snižují, což je dáno jednak jejich zpřesňováním, a také tím, že do databáze neustále přibývají nejmladší jalovičky z celého světa, které jsou samozřejmě geneticky vždy hodnotnější.


JAKÉ PLEMENNÉ HODNOTY JSOU VÝSLEDKEM

Z nejdůležitějších a nejzajímavějších plemenných hodnot jmenujme: 

Produkce:

  • Mléko = produkce mléka v lb (v evropských zemích je většinou v kg)
  • T = produkce mléčného tuku v lb
  • T (%) = produkce tuku v %
  • B = produkce mléčné bílkoviny v lb
  • B (%) = produkce bílkoviny v %
  • R = spolehlivost odhadu

SELEKCNI INDEXY

Selekční indexy:

  • NM$ - ekonomický index, který klade důraz na produkci a fitness
  • CHM = Cheese merit = index mlékařský a sýrařský, s ještě vyšším důrazem na produkci a výtěžnost mléka
  • TPI = americký selekční index se svýženým důrazem na vyjádření užitkového typu

Telení:

  • SCE = sire calving ease = snadnost telení po býkovi
  • DCE = daughter calving ease = snadnost telení dcer po býkovi

Exteriér:

  • R = spolehlivost odhadu
  • PTAT = vyjádření užitkového typu
  • UDC = celková kvalita utváření a funkce vemene
  • FLC = celková kvalita utváření a funkce končetin
  • BCS = body condition score = celková kvalita utváření těla
  • TPI
  • Z jednotlivých exteriérových znaků vybírám např.:
    • Front Teat Placement = rozmístění předních struků
    • Rear Teat Placement = rozmístění zadních struků
    • Teat Length = délka struků

 MARKERY PRIKLADMARKERY

Přibližně 1x za měsíc emailem obdržíte výsledky vyšetření markerů testovaných jaloviček.

Nalznete v nich následující výsledky:

  • Informace o mléčných bílkovinách (Kapa a Beta kaseiny, Beta laktoglobulin)
  • Nositelství letálních faktorů (BLAD, DUMP, CVM, Brachyspina, Citrullinemia)
  • Případnou přítomnost alely pro dominantně červené zbarvení (Dominant Red)
  • Další letální faktory (FMO3, SDM, SMA)
  • Nositelství alely DGAT (geneticky podmíněná zvýšená produkce mléčného tuku)
  • HCD - deficience cholesterolu (postižené jalovičky brzy hynou)
  • Haplotypy HH1 - HH6 (ovlivňují ranou embryonální mortalitu)

Markery jsou důležitou infomrací zejména pro tvorbu připařovacího plánu, který je musí vhodným způsobem zohlednit. Nositelky letálních faktorů a jiných nevhodných alel je vhodné v chovu postupně eliminovat fyzicky anebo eliminovat alespoň výskyt konkrétních nežádnoucích alel.


Klientský portál Genetic Visions

Klientský portál GV poskytne množství zajímavých dat a grafů, můžete v něm:

  • sledovat aktuální stav každé objednávky (skupiny odebraných vzorků odeslaných k testování)
  • zobrazit výsledky testování v tabulce za jednotlvé objednávky (skupiny vzorků) nebo za všechny testované jalovičky dohromady
  • zobrazit intervalové rozložení exteriérových znaků v celém stádě (upozorní na případné či vhodné šlechtitelské priority)
  • pod záložkou "Advanced search" je možno zvolit si pro vás zajímavé plemenné hodnoty a údaje a vybrat si, zda vás zajímají rodokmenové, genomické nebo jejich průnik, zobrazená data pak lze prohlížet, řadit, exportovat do Excelu

 Jak na to:

  • Po přihlášení uvidíte v záhlaví tzv. "Dashboard". Zde vidíte počet vzorků odeslaných k rozboru (Sent), počet vzorků doručených do laboratoře k rozboru (Arrived), počet vzorků odmítnutých (Rejected), aktuální počet nesrovnalostí v původech (Conflict) čekající na opravu a také počet vlastních a již hotových výrobků (Results). Po kliknutí na tento odkaz se Vám všechny zobrazí.GV1
  • V záhlaví zobrazných výsledů dále můžete zvolit možnost pokročilého vyhledávání (Advanced search), kde si pak můžete volit vlastní selekční kritéria, která Vás zajímají.
    GV2
  • Po kliknutí na "Advanced search" si volíte informace o zvířatech, která jsou por Vás zajímavá. Jednak je o identifikační údaje, dále produkční znaky, fitness, typ, fertilita a haplotypy. Kliknete na "Search" a vyčkáte. Dole se Vám posléze zobrazí vybraná data. Tam si můžete měnit pořadí sloupců (uchopením hlavičky a přetažením na místo, kde ho chcete mít), můžete si též libovolně zvířata řadit. Výsledný soubor můžete exportovat do Excelu, kde s ním lze dále pracovat (Export to Excel).
    GV3
  • Na úvodní straně pod Dashboardem lze také vidět jednotlivé obejdnávky s datem odeslání, datem doručení do laboratoře a jejich aktuální stav. Po kliknutí na zelenou ikonu "Result" se následně dostanete k výsledkům testování této skupiny vzorků.
    GV4
  • Po kliknutí na Results u jakékoliv objednávky v záhlaví rozborů uvidíte opět tabulku k filtrování dostupných výsledků. Pokud si v kolonce "Order" zvolíte "All" a v "Chart type" zvolíte "Linear", Genetic Visions Vám zobrazí intervalovou četnost znaků exteriéru všech zvířat, která jste odeslali k testování. To Vás může upozornit na problémy šlechtění jaloviček a na co se případně dále zaměřit ve šlechtění stáda, co korigovat a jakým směrem.
    GV5

Další informace o strategii šlechtění, využívání sex. ID a genomickém testování a jeho využití v praxi naleznete v naší prezentaci z února 2020. Obecně jsou výsledky genomického testování důležité pro toho, kdo Vám zpracovává připařovací plán, dále pro zpeněžení zvířat, embryí apod. Výsledky obecně ukazují na kvalitu šlechtitelské práce v minulosti.

Další výhodou genomického testování je kontrola původu jaloviček. Ne zřídka se při rozboru v laboratoři zjsití, že reálný původ zvířat (až do třetí generace!) je jiný, než jaký stojí v Plemdatu v české centrální evidenci.


V případě problémů se zobrazením a dohledáním výsledků nás neváhejte kontaktovat. Pomůže Vám Jana Brodská nebo Magdalena Zajíčková, kontakty naleznete v příslušné sekci.

Magdalena Zajíčková

 

ROLL UP inplem Kreslicí plátno 1

GALERIE

INPLEM s.r.o.

Dlouhá 311, 251 01 Tehov

Česká Republika

IČO 29128013

DIČ CZ29128013

INPLEM ANIMAL SERVICE s.r.o.

Dlouhá 311, 251 01 Tehov

Česká Republika

IČO 218 38 364

DIČ CZ21838364

Farma Tehov

Ing. Petr Zajíček

Dlouhá 311, 251 01 Tehov

Česká Republika

IČO 437 54 848

DIČ CZ 6801171795

EQUITEAM FARMA TEHOV z.s.

Jezdecký klub a spolek přátel Farmy Tehov.

Dlouhá 311, 251 01 Tehov

Česká Republika

IČO 9327886

Není plátce DPH